Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POMPQ9Y244 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POMPQ9Y244 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms