Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IGSF9BQ9UPX0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGSF9BQ9UPX0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms