Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP24Q9UPU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP24Q9UPU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP24Q9UPU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP24Q9UPU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms