Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETD1BQ9UPS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SETD1BQ9UPS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SETD1BQ9UPS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETD1BQ9UPS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SETD1BQ9UPS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms