Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A2Q9UPR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A2Q9UPR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms