Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HPCAL4Q9UM19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL4Q9UM19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPCAL4Q9UM19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms