Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PADI4Q9UM07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PADI4Q9UM07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PADI4Q9UM07 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PADI4Q9UM07 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms