Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNB3Q9ULL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLXNB3Q9ULL4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLXNB3Q9ULL4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms