Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DENND2AQ9ULE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DENND2AQ9ULE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DENND2AQ9ULE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms