Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDC42EP3Q9UKI2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDC42EP3Q9UKI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms