Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX41Q9UJV9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX41Q9UJV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX41Q9UJV9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms