Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP25Q9UHP3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP25Q9UHP3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP25Q9UHP3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms