Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FBXO40Q9UH90 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXO40Q9UH90 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO40Q9UH90 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms