Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF1Q9UH73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF1Q9UH73 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms