Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD2Q9UGT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD2Q9UGT4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD2Q9UGT4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD2Q9UGT4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms