Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTRF1LQ9UGC7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTRF1LQ9UGC7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTRF1LQ9UGC7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTRF1LQ9UGC7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms