Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN8Q9UBY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLN8Q9UBY8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms