Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNQ9P2M7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CGNQ9P2M7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CGNQ9P2M7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNQ9P2M7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms