Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPSF2Q9P2I0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPSF2Q9P2I0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPSF2Q9P2I0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms