Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGFRNQ9P2B2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGFRNQ9P2B2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGFRNQ9P2B2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms