Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN3Q9P1Z3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms