Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HMG20BQ9P0W2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HMG20BQ9P0W2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.5 ms