Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMCD1Q9NZU5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMCD1Q9NZU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMCD1Q9NZU5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms