Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKIPSDQ9NZQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms