Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ARHGEF12Q9NZN5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ARHGEF12Q9NZN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ARHGEF12Q9NZN5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF12Q9NZN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF12Q9NZN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms