Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD3Q9NZN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD3Q9NZN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms