Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRNAU1APQ9NX07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNAU1APQ9NX07 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNAU1APQ9NX07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms