Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 220.89■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 518.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CCDC43-205ENST00000592333 692 ntTSL 218.77■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CCDC43-204ENST00000588687 721 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-203ENST00000503030 909 ntTSL 317■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 216.84■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-202ENST00000399213 1636 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 NCAPH2-210ENST00000523045 970 ntTSL 516.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 AP3D1-210ENST00000591631 796 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 415.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 515.11■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-244ENST00000640174 1125 ntTSL 514.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 514.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 LEMD2-213ENST00000514636 544 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-208ENST00000514705 4445 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 TSPAN17-206ENST00000507471 707 ntTSL 313.65□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-251ENST00000640870 1687 ntTSL 513.56□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-206ENST00000466394 782 ntTSL 513.47□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 513.1□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 LEMD2-209ENST00000511171 4870 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 LEMD2-204ENST00000502643 583 ntTSL 411.83□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-217ENST00000492581 3925 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-229ENST00000638698 1302 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-211ENST00000579340 1168 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-225ENST00000638193 1342 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-209ENST00000578801 1264 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 PI4KA-211ENST00000482030 655 ntTSL 210.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DHCR24-202ENST00000436604 863 ntTSL 39.95□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 RIF1-202ENST00000414861 2534 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-203ENST00000467533 663 ntTSL 39.84□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 29.81□□□□□ -0.845e-14■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-207ENST00000474676 603 ntTSL 59.74□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-224ENST00000617949 705 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-205ENST00000469550 1952 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 DPM1-206ENST00000494752 789 ntTSL 39.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-237ENST00000639521 952 ntTSL 59.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-212ENST00000492407 782 ntTSL 59.06□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-250ENST00000640827 1596 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-202ENST00000459727 524 ntTSL 58.94□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 LEMD2-212ENST00000513832 821 ntTSL 48.91□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 HDAC3-211ENST00000491581 777 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-227ENST00000638309 1383 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 58.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 41.1
RBM22Q9NW64 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 41.1
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