Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3BQ9NW08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3BQ9NW08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3BQ9NW08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms