Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR3EQ9NVU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3EQ9NVU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3EQ9NVU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms