Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBNL3Q9NUK0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MBNL3Q9NUK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms