Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUB1

ACSS1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1Q9NUB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS1Q9NUB1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS1Q9NUB1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS1Q9NUB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS1Q9NUB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS1Q9NUB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS1Q9NUB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms