Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms