Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLSCR3Q9NRY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLSCR3Q9NRY6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLSCR3Q9NRY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms