Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB6BQ9NRW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6BQ9NRW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB6BQ9NRW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB6BQ9NRW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms