Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PAPLN-207ENST00000555123 4108 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-208ENST00000489710 394 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-203ENST00000455311 810 ntTSL 514.51□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-210ENST00000573629 423 ntTSL 314.5□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.125e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-205ENST00000445472 639 ntTSL 414.18□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-223ENST00000513101 564 ntTSL 413.38□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-212ENST00000573625 602 ntTSL 313.34□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-217ENST00000510262 407 ntTSL 513.26□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBC1D9B-214ENST00000522029 616 ntTSL 313.21□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 512.44□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-206ENST00000466445 554 ntTSL 412.27□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 511.56□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-207ENST00000486308 574 ntTSL 311.44□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP17-219ENST00000575975 681 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ELL2-208ENST00000635633 467 ntTSL 311.27□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SCAF4-204ENST00000467731 2976 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-209ENST00000597805 135 ntTSL 510.14□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 G3BP2-210ENST00000507745 584 ntTSL 410.11□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-208ENST00000597205 169 ntTSL 59.32□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC8.41□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRDM4-206ENST00000550659 837 ntTSL 38.34□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KIF18A-202ENST00000526288 744 ntTSL 27.81□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-212ENST00000509886 692 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TBC1D9B-203ENST00000517782 283 ntTSL 54.16□□□□□ -1.745e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-207ENST00000505437 443 ntTSL 32.75□□□□□ -1.975e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-206ENST00000462341 320 ntTSL 31.36□□□□□ -2.195e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)26.35■■□□□ 1.817e-7■■■■■ 46.1
DROSHAQ9NRR4 EXD3-206ENST00000478344 2932 ntTSL 220.82■□□□□ 0.927e-7■■■■■ 46.1
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.146e-11■■■■■ 46.1
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-205ENST00000457876 646 ntTSL 326.33■■□□□ 1.818e-10■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)31.59■■■□□ 2.659e-7■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 45.9
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-221ENST00000476940 414 ntTSL 521.78■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 514.62□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 414.54□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 412.18□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 211.99□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-209ENST00000518509 569 ntTSL 410.92□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 210.58□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 45.8
DROSHAQ9NRR4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 45.6
DROSHAQ9NRR4 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.623e-14■■■■■ 45.6
DROSHAQ9NRR4 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 214.75□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 45.6
DROSHAQ9NRR4 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.617e-11■■■■■ 45.6
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 521.61■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 RCL1-208ENST00000448872 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 RCL1-202ENST00000381730 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 RCL1-201ENST00000381728 758 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 45.3
DROSHAQ9NRR4 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.327e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 234.25■■■■□ 3.077e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 330.64■■■□□ 2.57e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.187e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 528■■■□□ 2.077e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.94■■□□□ 1.427e-7■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-207ENST00000460505 1886 ntTSL 1 (best)35.63■■■■□ 3.292e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.072e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.562e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-203ENST00000420952 881 ntTSL 530.03■■■□□ 2.42e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-211ENST00000484831 1727 ntTSL 528.68■■■□□ 2.182e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-215ENST00000498794 2987 ntTSL 224.46■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 45.1
DROSHAQ9NRR4 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 45
DROSHAQ9NRR4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.121e-6■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.031e-6■■■■■ 44.8
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