Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLE3Q9NRF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms