Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO8Q9NRD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO8Q9NRD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO8Q9NRD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms