Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BIN3Q9NQY0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BIN3Q9NQY0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BIN3Q9NQY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BIN3Q9NQY0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
BIN3Q9NQY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BIN3Q9NQY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BIN3Q9NQY0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms