Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INCENPQ9NQS7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INCENPQ9NQS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INCENPQ9NQS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
INCENPQ9NQS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms