Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A2Q9NQ11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP13A2Q9NQ11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms