Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CENPJQ9HC77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CENPJQ9HC77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CENPJQ9HC77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CENPJQ9HC77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms