Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ELP3Q9H9T3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ELP3Q9H9T3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ELP3Q9H9T3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms