Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7BQ9H9Q2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms