Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP1Q9H902 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP1Q9H902 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms