Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNDIG1Q9H7V2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNDIG1Q9H7V2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNDIG1Q9H7V2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms