Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXO5Q9H790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXO5Q9H790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXO5Q9H790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXO5Q9H790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms