Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XKR8Q9H6D3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XKR8Q9H6D3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms