Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PIF1Q9H611 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms