Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD1Q9GZZ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD1Q9GZZ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD1Q9GZZ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms